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Fibao Una perspectiva molecular en medicina
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TÉRMINOS DEL GLOSARIO correspondientes a: T
Taxonomía:
Fecha de incorporación al glosario: 17-10-2007 Fecha de la última modificación: 17-10-2007
Definición: La taxonomía es la ciencia que trata de los principios, métodos y fines de la clasificación. En biología, se aplica para la ordenación jerarquizada y sistemática, con sus nombres, de todos los seres vivos.
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Tecnologías De Secuenciación Masiva:
Fecha de incorporación al glosario: 14-12-2016 Fecha de la última modificación: 14-12-2016
Definición: La secuenciación masiva, NGS (del inglés Next Generation Sequencing) es una tecnología de secuenciación ADN, es decir, permite establecer el orden de los nucleótidos en un fragmento de ADN. La llamada NGS es capaz de realizar múltiples secuencias de forma paralela, produciendo millones de secuencias al mismo tiempo y a un coste muy bajo. Gracias a la secuenciación masiva se puede secuenciar, en lugar de un gen, múltiples genes o incluso un genoma completo. Las ventajas de la secuenciación masiva frente a la secuenciación convencional residen en la amplitud del análisis, necesidad de una menor cantidad de material genético, un menor coste y una mayor rapidez. El flujo de trabajo en rasgos generales consta de los siguientes pasos: construcción de la librería (dependerá del análisis a realizar: transcriptoma, genoma completo, 16S…), preparación del template, secuenciación y análisis de los datos. Dichas tecnologías a su vez se diferencian en la longitud de las reads, los errores cometidos, el rendimiento y el precio,ajustándose la elección de la plataforma utilizada a las necesidades de cada proyecto. La secuenciación masiva se puede realizar a diferentes niveles y con diferentes longitudes de lectura, diferenciando entre Short-read y Long-read Dentro de las plataformas que utilizan Short-read encontramos diferentes tecnologías: Illumina, la cual utiliza tecnologías de secuenciación por síntesis, utilizando moléculas terminadoras marcadas con fluorescencia, cuyos terminadores pueden ser eliminados permitiendo que la siguiente base se añada, determinando así la composición de la hebra de ADN. Algunos de sus equipos son MiSeq, NextSeq 500 o HiSeq 3000. Ion Torrent, por otro lado, detecta los protones que se liberan al incorporarse cada dNTP, identificando sus diferentes equipos cada nucleótido mediante variaciones de pH. Algunos de sus equipos son Ion S5 o Ion Chef. Las secuencias individuales más cortas contienen más errores que la secuencias obtenida por Sanger (método convencional de tipo enzimático, donde se copia una cadena de ADN mediante el uso de dideoxinucleótidos, que provocan que la cadena termine al incorporarse dichas bases a la cadena. La cadena final se resuelve por electroforesis capilar), pero, como pueden repetirse múltiples veces (conocido como coverage), se llega a conocer la secuencia de millones de pares de bases. Dentro de las tecnologías de Long-reads, diferenciamos entre: PacBio, en la que su tecnología está basada en SMRT (del inglés Single Molecule Real-Time) por tanto, aprovechando el proceso de replicación del ADN se puede observar la síntesis de ADN, de tal manera que los 4 nucleótidos estarán marcados con fluorescencia generando espectros de emisión diferentes y de esta manera determinar de qué nucleótido se trata. Oxford nanopore es un secuenciador de ADN portable y a tiempo real en el cual encontramos nanoporos proteicos insertados en una membrana polimérica al cual se le aplica un potencial, de tal manera que el ADN pasa base a base por el nanoporo apareciendo diferencias de potencial dependiendo de la base que pase y determinando así el orden de las bases de la hebra de ADN. La secuenciación masiva está hoy en día en auge, encontrando grandes proyectos internacionales. Uno de los grandes proyectos de secuenciación masiva, es el proyecto de los 1000 genomas en el que se ha secuenciado el genoma de 2504 personas de 26 poblaciones diferentes de todo el mundo con objeto de catalogar la variación genética en el ser humano, a su vez ha permitido caracterizar la historia y demografía de las poblaciones humanas ancestrales.
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Tirosina:
Fecha de incorporación al glosario: 20-8-2007 Fecha de la última modificación: 11-11-2007
Definición: La tirosina es un aminoácido aromático neutro, al igual que el triptófano y la fenilalanina, aunque tiene un OH que le confiere cierta polaridad y a pH elevado se ioniza. Su símbolo es Y en código de una letra y Tyr en código de tres letras. Es precursor de ciertos neurotransmisores, de las hormonas tiroideas y de las melaninas. Dentro de las células, su fosforilación es clave en muchos procesos de señalización
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Toxinas Formadoras De Poros (PFTs):
Fecha de incorporación al glosario: 27-12-2012 Fecha de la última modificación: 27-12-2012
Definición: Las toxinas formadoras de poros (PFTs) son complejos de naturaleza proteica, fabricados por ciertas bacterias para atacar a las células del organismo infectado. Este ataque se lleva a cabo mediante la formación de poros en la membrana celular.
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Transcriptoma:
Fecha de incorporación al glosario: 2-3-2009 Fecha de la última modificación: 2-3-2009
Definición: El transcriptoma es el conjunto de genes que se están expresando en un momento dado en una célula. La expresión de un gen supone que éste ha sido transcrito a ARN mensajero. Células de un mismo organismo y con un mismo genoma pueden llegar a ser tipos celulares muy dispares dependiendo de la combinación de genes que exprese cada una, lo que es lo mismo, dependiendo de su transcriptoma.
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Transferencia Horizontal:
Fecha de incorporación al glosario: 10-1-2014 Fecha de la última modificación: 10-1-2014
Definición: La transferencia genética horizontal se refiere a cualquier proceso mediante el cual se transfiere material genético de un organismo donador a un receptor no descendiente.
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Transportador ABC:
Fecha de incorporación al glosario: 22-3-2013 Fecha de la última modificación: 22-3-2013
Definición: Los transportadores ABC (del inglés ATP binding cassette) son proteínas en su mayoría especializadas en el transporte activo de sustancias a través de la membrana celular, aunque hay algunos miembros de esta familia que ejercen otras funciones. Constituyen una gran superfamilia de proteínas con representantes en todos los organismos uni y pluricelulares.
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Transposón:
Fecha de incorporación al glosario: 9-1-2014 Fecha de la última modificación: 9-1-2014
Definición: Un transposón es un fragmento del genoma que puede cambiar de forma autónoma su ubicación dentro del mismo.
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Treonina:
Fecha de incorporación al glosario: 20-8-2007 Fecha de la última modificación: 11-11-2007
Definición: La treonina es un aminoácido polar, no cargado a pH neutro. Su símbolo es T en código de una letra y Thr en código de tres letras. Es un aminoácido esencial. Sufre fosforilación y O-glicosilación. Su fosforilación es importante en señalización intracelular.
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Triglicéridos:
Fecha de incorporación al glosario: 11-11-2007 Fecha de la última modificación: 11-11-2007
Definición: Los triglicéridos son la principal forma de almacenamiento de energía en las células. Son lípidos formados por una molécula de glicerol esterificado con tres ácidos grasos
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Triptófano:
Fecha de incorporación al glosario: 20-8-2007 Fecha de la última modificación: 11-11-2007
Definición: El triptófano es un aminoácido aromático neutro, al igual que la tirosina y la fenilalanina. Su símbolo es W en código de una letra y Trp en código de tres letras. Es un aminoácido no polar. Es precursor del neurotransmisor serotonina, de la melatonina y de la vitamina B3 o niacina.
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